جهت ارزیابی اثر متقابل ژنوتیپ و محیط کشور ایران به چهار اقلیم سرد، نیمه سرد، معتدل و گرم تقسیم بندی شد. بدین منظوربه ترتیب از 39570 رکورد مقدار شیر جهت آزمون نتاج 35 گاو نر که در هر اقلیم حداقل دارای 50 دختر بودند استفاده شد. رکوردهای مورد استفاده طی سال های 1370 تا 1388 توسط مرکز اصلاح نژاد و بهبود تولیدات دامی کشور از 775 گله جمع آوری شده بودند. ارزش اصلاحی حیوانات برای صفات مقدار شیر با استفاده از مدل حیوانی دارای خاصیت BLUP و آنالیز سه صفته پیش بینی شدند. میانگین ارزش اصلاحی پیش بینی شده پدران در اقلیم های سرد، نیمه سرد، معتدل و گرم برای مقدار شیر به ترتیب 53/75، 74/377، 08/167 و 49/81 کیلوگرم برآورد شد. همچنین همبستگی رتبه ای پدران برای اقلیم های سرد- نیمه سرد، سرد- معتدل ، سرد-گرم، نیمه سرد - معتدل، نیمه سرد- گرم و معتدل-گرم به ترتیب 63/0، 61/0، 45/0، 87/0، 54/0 و 48/0برآورد شد. بنابراین با توجه به هبستگی رتبه ای برآورد شده رتبه بندی پدرها در مناطق مختلف متفاوت بوده است. بنابراین اثر متقابل ژنوتیپ و محیط برای مقدار شیر در مناطق مختلف ایران وجود دارد.