1403/02/14
امیر رشیدی

امیر رشیدی

مرتبه علمی: استاد
ارکید:
تحصیلات: دکترای تخصصی
اسکاپوس: 23009961900
دانشکده: دانشکده کشاورزی
نشانی: سنندج- دانشگاه کردستان- دانشکده کشاورزی - گروه علوم دامی
تلفن: 08733668512

مشخصات پژوهش

عنوان
پویش ژنومی نشانه‌های انتخاب در گوسفندان پوستی و پشمی ایرانی با استفاده از روشهای برآوردگر نااُریب FST و hapFLK
نوع پژوهش
مقاله چاپ‌شده در مجلات علمی
کلیدواژه‌ها
آزمون تتا، آزمون hapFLK، پویش ژنومی، گوسفندان ایرانی، نشانه های انتخاب
سال 1402
مجله تحقیقات تولیدات دامی
شناسه DOI
پژوهشگران زهرا پتی‌آبادی ، محمد رزم کبیر ، علی اسمعیلی‌زاذه کشکوئیه ، محمد حسین مرادی ، امیر رشیدی

چکیده

بررسی نشانه‌­های انتخاب در کل ژنوم به شناسایی ساز و کارهای انتخاب و تشخیص مناطقی از ژنوم که طی سالیان متمادی به­صورت طبیعی و یا مصنوعی انتخاب شده­اند، کمک می­کند. هدف از این پژوهش، شناسایی نقاطی از ژنوم در گوسفندان پوستی و پشمی بود که طی سال­های مختلف انتخاب شده­اند. بدین منظور، 80 رأس گوسفند پوستی (قره­گل، سیاه­کبود و کبوده­شیراز) و پشمی (سنجابی، کرمانی و بلوچی) با استفاده از آرایه­های گوسفندیk 600 تعیین ژنوتیپ شدند. برای شناسایی نشانه­های انتخاب از آزمون نااُریبFST (تتا) و آزمون hapFLK استفاده شد .نتایج تتا، 26 منطقۀ ژنومی روی کروموزوم­های 1، 2، 6، 19 و 24، و نتایج hapFLK، هفت منطقه ژنومی روی کروموزوم­های 6 و 19 شناسایی کرد. تجزیه و تحلیل اطلاعات زیستی (بیوانفورماتیکی) نشان داد که برخی از این مناطق ژنومی با ژن­های مؤثر بر صفات رنگدانه و مشخصات پشم (KIT، MITF، IGSF10 و PDGFRA)، عضلات (MICALL2)، اتساع عروق و پاسخ ایمنی (P2RY) و سرطان (MIR339، ELFN1، MAD1L1 و GPR87) هم­پوشانی دارند. بررسی QTLهای گزارش شده نیز نشان داد که این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با مشخصات گوشت، لاشه، شیر، وزن بدن، تراکم استخوان و تعداد کل بره­های متولد شده در ارتباط هستند. همچنین نواحی مورد انتخاب با مسیرهای درگیر در تمایز ملانوسیت و رنگدانه­ها، تمایز سلول­های بنیادی، فرآیندهای سلولی، توسعه سیستم ایمنی، سیستم خونی، فرآیندهای باروری و سلولی ارتباط داشتند. به هر حال، برای شناسایی نقش دقیق ژن­ها و QTLهای شناسایی شده، لازم است مطالعات تکمیلی انجام گیرد.