فناوری نانو شامل استفاده از مواد در مقیاس نانو برای تولید محصولات جدید طی پروسه های مختلف است. به عنوان مثال با استفاده از فناوری نانو خوراک مناسب تری را می توان تولید نمود. با توجه به برخی مطالعات، نانوذرات عناصری مانند سلنیوم، آهن و غیره منابع مکمل در رژیم غذایی هستند که می توانند رشد ماهی را بهبود بخشند. مواد جدید بدست آمده توسط فناوری نانو می توانند در جنبه های مختلف شیلات و آبزی پروری مورد استفاده قرار گیرد. از این فناوری می توان در آکواریوم و حوضچه های پرورش ماهیان تجاری جهت کاهش هزینه های مربوط به تصفیه آب کمک گرفت. محققان بر این باورند که فناوری نانو می تواند ارئه کننده مسیری جهت حفاظت از استخرهای پرورش ماهی در برابر عوامل بیماری زا باشد. یکی دیگر از امکانات فناوری نانو استفاده از روش های مختلف حفاظت و بسته بندی غذاهای دریایی جهت جلوگیری و به تعویق انداختن فساد آنزیمی و میکروبی است. نانوفیلتراسیون و فرایند اسمز معکوس جهت کاهش شوری آب های مورد استفاده در شستشو و فراوری غذاهای دریایی کاربرد دارد. نانوفیلتراسیون می تواند کیفیت آب را تا حد بالای بهبود بخشد. استفاده از فناوری نانو در صنایع شیلاتی و آبزی پروری نیازمند برقراری تعادل با محیط زیست بویژه اثرات نانومواد بر موجودات آبزی و همچنین بهداشت حرفه ای کارگران است. بنابر این باید اثرات جانبی برخی از برنامه های کاربردی نانوتکنولوژی بر محیط زیست در آینده مورد توجه قرار گیرد.