به منظور شناسایی ماهیان قنوات و رودهای دائمی شهرستان قائنات، طی سالهای 1385و1386 در چهار منطقه مرکزی، نیمبلوک، زیرکوه و زهان، نمونه برداری از 67 قنات و 6 رود با استفاده از تور پره با چشمه های 2 میلی متر انجام شد. نمونه های صید شده در فرمالین 10 % تثبیت و پس از انتقال به آزمایشگاه با استفاده از کلید های شناسایی تا حد گونه مورد شناسایی قرارگرفتند. از 73 منبع آبی مورد بررسی، تنها در 22 قنات و 4 رود ماهی وجود داشت. گونه های شناسایی شده در این منابع آبی شامل گونه گامبوزیا (Gambusia holbrooki) از خانواده کپورماهیان دندان دار و گونه سیاه ماهی (Capoeta fusca) از خانواده کپورماهیان می باشند. سیاه ماهی گونه ای است که تنها از شرق ایران گزارش گردیده و به همین دلیل از نظر حفظ ذخایر ژنتیکی بومی کشور ایران، بسیار با ارزش می باشد.