میکروسکوپ فلورسنس در بررسی و مطالعه زیست شناسی مولکولی نقش بسزای داشته است. امروزه تصویربرداری فلورسنس به عنوان یک ابزار اصلی در زیست شناسی، مخصوصا در مطالعه پدیده های مرتبط با غشائ سلولی، شکل سلول، حرکت سلول و چسبندگی موضعی سلول در نظر گرفته می شود. دانستن اصول و قوانین مربوطه بسیار مفید خواهد بود. مطالعه ناحیه تماس با زیر لایه و بررسی پدیده های مربوط به زیست شناسی سلولی در سال های اخیر رشد سریعی داشته است. و اهمیت تصویربرداری از این پدیده ها باعث رشد پدیده های متفاوتی در این زمینه شده است. که از جمله ی آن می توان به اختراع میکروسکوپ میدان میرا اشاره کرد. در این میکروسکوپ میدان میرا برای تحریک فلوروفورها مورد استفاده قرار می گیرد. این فلوروفورها فقط در یک ناحیه محدود در نزدیک سطح مشترک زیر لایه و نمونه تحریک می شوند. این ویژگی موجب شده است که میکروسکوپ میدان میرا به یک ابزار توانمند برای مطالعه ی پدیده های زیست شناسی سلولی تبدیل شود و در خیلی از کاربردها از جمله مطالعه نواحی تماس با زیر لایه، اسپکتروسکوپی تک مولکولی نزدیک سطح و بررسی دینامیک سلول های زنده با قدرت تشخیص بالا نقش مهمی را ایفا کند. حدود چهار دهه پیش روش (IRM) باعث پیشرفت خوبی در مطالعه ناحیه تماس سلول با زیر لایه شد. در این روش یک باریکه نور بر یک قطعه شیشه اپتیکی شفاف و بعد از باز تابش های متوالی از لایه ها و سطح مشترک های متفاوت، به نمونه برخورد می کند و آن را روشن می کند. اما این روش مشکلات و کاستی هائی دارد، از جمله ارائه ندادن اطلاعات روشن وکافی در مورد ابعاد و خصوصیات ذاتی سلول و زیرلایه، یک روش جایگزین مناسب برای IRM میکروسکوپ فلورسنس باز تابش داخلی کلی(TIRFM) است. این ابزار و روش توانمند ابتدا در زیست شناسی سلولی مورد استفاده قرار گرفت، همچنین این روش در مطالعه ناحیه تماس سلولی با زیر لایه و ارائه کیفی نقشه و توپوگرافی آن مورد استفاده قرار گرفته است. این روش دارای کاربردهای فراوانی در زمینه های مختلف می باشد. از جمله تصویر برداری از ناحیه سلول های زنده با زیر لایه، بررسی دینامیک سلولی در ناحیه تماس، میکروسکوپی تک مولکولی، مطالعه کوانتومی دات ها ، بیو شیمی و اسپکترومتری. تحریک مولکول های فلورسنس توسط میدان میرا می تواند به وسیله موجبرهای تخت هم انجام گیرد که در آن محیط مایع، لایه رویه موجبر را تشکیل می رهد. موجبر ها ساختارهای اپتیکی هستند که برای محدود کردن و هدایت امواج الکترو مغناطیسی مورد استفاده قرار می گیرند. در این راستا یک جایگزین مناسب برای روش TIRFM می تواند میکروسکوپ فلورسنس میدان میرای موجبر (WEFFM) باشد. که میکروسکوپی است مانند TIRMF از میدان میرا برای تحریک فلوروفورها استفاده می کند. از WEFFM برای تصویر برداری از فیلم های بسیار نازک و سلول های زنده که روی سطح موجبر قرار دارند، مطالعه ناحیه تماس سلول های زنده، دینامیک مربوط به سلول ها تعیین فاصله سلول از سطح موجبر، بررسی توزیع و غلظت فلورو فلورها نزدیک سطح استفاده شده است. در این تکنیک موجبرها که اصلی ترین نقش را ایفا می کنند به عنوان زیر لایه های میکروسکوپی مورد استفاده قرار می گیرند. میکروسکوپ میدان میرای موجبری دارای قدرت تشخیص نانومتری در راستای قائم است. این بدان معناست که قدرت تشخیص این میکروسکوپ در مقایسه با میکروسکوپ هایی غیر میدان میرا بسیار بالاست. ساختارهای رزونانسی همانطوری که از اسم شان پیداست یک تشدید کننده یا تقویت کننده، از جمله تقویت کننده شدت میدان الکتریکی هستند و کاربردهای بسیار زیادی از جمله در میکروسکوپ های میدان میرای موجبری دارند. در این پایان نامه می خواهیم نتایج ناشی از بررسی ساختارهای رزونانسی را با استفاده از کدها و نمودارها مورد تجزیه و تحلیل قرار دهیم.
