استا ن کردستان از لحاظ سطح زیرکشت و تو لید در مقام اول کشور قر ار دارد. 99درصد مزارع توت فرنگی استان در سه شهرستان سنندج ، سروآباد و کا میاران و اقع گشته اند. در سال های اخیر، نظام های مارکر عمدتا" از روش های سریع و ارزان مبتنی بر PCR بهره برداری می نمایند که به نظر می رسد استفاده از این روش ها برای تعیین تنوع ژنتیکی و دسته بندی ژنتیکی ژنوتیپ های توت فرنگی کردستانی کمک شایانی نماید. بنابر این مطالعه حاضر برخی ژنوتیپ های توت فرنگی رقم کردستان در مناطق سنندج، کامیاران، سروآباد و مریوان را با استفاده از نشانگرهای -AFLP مورد بررسی قرار می دهد. روشMurray and Thompson (1980) جهت استخراج DNA از گیاه توت فرنگی مناسب تشخیص داده شد و با تغییراتی در این روش، استخراج DNA از 36 ژنوتیپ توت فرنگی رقم کردستان انجام گرفت. با بررسی شرایط و غلظت های مختلف ترکیبات محلول واکنش هضم آنزیمی و PCR، شرایط و غلظت بهینه مواد تشکیل دهنده این محلول مشخص گردید. مجموعا" 13 ترکیب آغازگری مورد آزمایش قرار گرفت که 10 ترکیب آغازگری در بین دو یا چند ژنوتیپ چند شکلی نشان دادند. داده های مولکولی حاصل از رنگ آمیزی ژل توالی یاب بر اساس صفر و یک کد گذاری شدند و با استفاده از نرم افزار NTSYS Ver. 2.02 و با روش جاکارد ماتریس تشابه تهیه و دندروگرام مربوط به 36 رقم ترسیم شد. با توجه به جدول ماتریس تشابه، بیشترین تشابه بین نمونه های مریوان و سروآباد با میانگین ضریب تشابه 1/73 درصد و کمترین تشابه بین نمونه های مریوان و اطراف سنندج با ضریب تشابه 3/47 درصد می باشد. در دندروگرام حاصله در درصد تشابه 52%، 36 ژنوتبپ در سه گروه مجزا جای گرفتند. گروه بندی به دست آمده همبستگی نسبی ای بین پراکنش جغراقیایی و دسته بندی ژنتیکی نشان داد. این پژوهش برای اولین بار در ایران ارزیابی تنوع ژنتیکی در توت فرنگی را با استفاده از AFLP انجام می گیرد.