نرم افزارهای متعددی به منظور استفاده در تحقیقات و پروژه های اصلاح دام در دسترس هستند. در این کارگاه آموزشی، تعدادی از معتبرترین نرم افزارهای مورد استفاده در بخش اصلاح نژاد دام تدریس شد. به طور یقین، DMU یکی از جامع ترین برنامه های ارزیابی ژنتیکی در بخش اصلاح نژاد دام است. این نرم افزار اولین بار در بخش اصلاح نژاد گاو شیری موسسه ملی علوم دامی دانمارک، توسط Madsen & Jensen ارائه شد. این بخش، اکنون به عنوان مرکز ژنتیک و ژنومیک دانشگاه آرهوس (University of Aarhus) شناخته می شود. نرم افزار در دو نسخه تحقیقاتی و تجاری موجود است. نسخه تجاری قابلیت کار با داده های بزرگ را دارد و برای ارزیابی های رسمی و ملی کاربرد دارد. نسخه تجاری لازم است به طور رسمی از دانشگاه آرهوس خریداری شود تا از حمایت و پشتیبانی برخوردار باشد. نسخه تحقیقاتی نرم افزار نیز به صورت رایگان قابل دریافت است و در بسیاری از دانشگاه ها و مراکز پژوهشی مورد استفاده قرار می گیرد. نرم افزار قابلیت استفاده در سیستم عامل های ویندوز و لینوکس را دارد. این برنامه مدل های متنوعی از جمله مدل چند صفتی، مدل آستانه ایی و مدل های رگرسیون تصادفی را پوشش می دهد. همچنین می توان برای برآورد اجزای واریانس از روش های حداکثر درستنمائی (Maximum Likelihood Estimation) و روش های بیزین (Bayesian Estimation) بهره گرفت.
