انتخاب ژنومی یک ابزار جدید برای برآورد ارزش های اصلاحی صفات کمی با استفاده از نشانگرهای مولکولی است. معیار کارایی انتخاب ژنومی، دقت پیش بینی ارزش های اصلاحی ژنومی می باشد. در این تحقیق دقت پیش بینی ژنومی روشهای پارامتری و ناپارامتری در 345 گاو هلشتاین محاسبه گردید. صفات مورد تحقیق مقدار شیر، میزان چربی، میزان پروتئین و سلولهای سوماتیک شیر بود. دو روش پارامتری بهترین پیش بینی نا اریب خطی ژنومیک (GBLUP) و بیز B و دو روش ناپارامتری فضای هیلبرت با هسته بازآفرین (RKHS) و شیکه های عصبی (NN) برای برآورد تاثیرات نشانگرها و پیش بینی و دقت ارزش های اصلاحی ژنومی استفاده شد. دقت پیش بینی ژنومی در دامنه 0.39 ( برای سلولهای سوماتیک) تا 0.73 ( برای تولید چربی) محاسبه شد. بیز B و دو روش ناپارامتری در مقایسه با روش GBLUP دچار کوچک کردن بیشتر پیش بینی ها شده بودند ( منحنی ضریب رگرسیون ارزش اصلاحی ژنومی بر ارزش اصلاحی کلاسیک بیشتر از یک بدست آمد). در مقایسه با کلیه روشها دقت بیز B بیشتر شد. میانگین مربعات خطای پیش بینی برای روش GBLUP نسبت به دیگر روش ها برای صفات مطالعه شده کمتر برآورد شد. مدل رگرسیون بیز B برای انتخاب ژنومی در این جمعیت مطلوب بود، ولی برای بهبود دقت توسط این روش نیاز به کاهش آب رفتگی پیش بینی در این روش است.