مقدمه: در سازمان های دولتی، بودجه ریزی نقش بسزایی در مصرف بهینه منابع مالی دارد. بودجه ریزی مبتنی بر عملکرد ابزاری مناسب برای ارزیابی عملکرد هر سازمان است و استقرار نظام حسابداری تعهدی نقش غیرقابل انکاری در تدوین نوع بودجه ریزی دارد. روش پژوهش: پژوهش حاضر از لحاظ هدف کاربردی و از لحاظ شیوه گردآوری داده ها توصیفی از نوع همبستگی است. جامعه آماری پژوهش شامل مدیران مالی و کارشناسان حسابداری دانشگاه های علوم پزشکی کل کشور است. نمونه ای به حجم 225 نفر به شیوه نمونه گیری طبقه بندی منظم انتخاب و مورد بررسی قرار گرفت. ابزار گردآوری داده ها دو پرسش نامه پژوهشگر ساخته یکی برای حسابداری تعهدی و دیگری برای بودجه ریزی مبتنی بر عملکرد است که روایی آن از دیدگاه صاحب نظران و پایایی آن از طریق آلفای کرونباخ بررسی و مورد تایید قرار گرفت. برای تجزیه و تحلیل داده ها با بکارگیری نرم افزار SPSS نسخه 20 از روش تحلیل عاملی اکتشافی، آزمون همبستگی پیرسون و رگرسیون استفاده شد. یافته ها: بین حسابداری تعهدی و ابعاد گوناگون بودجه ریزی مبتنی بر عملکرد (برنامه ریزی، تحلیل هزینه ها، مدیریت عملکرد، مدیریت تغییر، پاسخ گویی و انگیزش) رابطه مثبت و معناداری وجود دارد. نتیجه گیری: فراهم کردن زیرساخت های لازم برای اجرای مناسب و کارآمد بودجه ریزی مبتنی بر عملکرد از جمله اولویت های اساسی هر سازمانی به حساب می آید. یکی از عوامل تشکیل دهنده این زیرساخت ها، حسابداری تعهدی است. در صورت اجرای نظام حسابداری تعهدی، اطلاعات دقیق تـر و کامل تـر از درآمدها و هزینه های هر دوره بدست آمده و امکان تدوین بودجه ریزی مبتنی بر عملکرد به شیوه نظام مند و درست فراهم می شود.